O SAAE foi fundado em 18 de junho de 1968, a partir da Lei Lei nº 1.106 e sua primeira denominação foi Serviço Autônomo de Água e Esgoto da Estância de Atibaia, nome que permaneceu até 2001, quando passou a se chamar Saneamento Ambiental de Atibaia.
Compete ao SAAE operar, manter, conservar e explorar os serviços públicos de água potável e de esgoto sanitário em todo município de Atibaia. Assim, toda obra que implique interferência nos sistemas de água e esgoto (manutenção de ramais, troca de hidrômetros, deslocamento de cavaletes, por exemplo) somente poderá ser feita pelo SAAE, através de seus funcionários especialmente treinados e capacitados.
Com a entrada em vigor da Lei Complementar nº 381/01, passou também a ser de competência do SAAE estudar, projetar, fiscalizar, manter, conservar e explorar, direta ou indiretamente os serviços relativos aos resíduos sólidos (lixo) do município. Assim, cabe ao SAAE a gestão dos sistemas de coleta, tratamento, transbordo e dispensa final do lixo.
Sua administração atualmente é exercida por um Diretor Superintendente, diretorias Administrativa, Comercial, Técnica e de Resíduos Sólidos, gerências de setores e assessorias Jurídica, Técnica, de Educação Ambiental e de Comunicação e Marketing.
O SAAE tem hoje cerca de 280 funcionários.
A organização administrativa é distribuída em dez gerências distintas: Recursos Humanos; Suprimentos; Informática; Receita; Contábil e Financeira; de Engenharia; de Operações; de  Produção; de Reciclagem e, por fim, de Coleta e Destinação Final de Resíduos Sólidos. 
A receita do SAAE provém dos valores arrecadados com consumo de água; utilização da rede de esgoto; ligações e religações de água e esgoto; disponibilidade das redes; coleta de lixo; contribuição de melhoria e outros decorrentes dos serviços prestados à população.
Suas contas são fiscalizadas pelo Tribunal de Contas do Estado de São Paulo. Assim, todas as receitas e despesas (com funcionários, compras, prestação de serviços, obras, etc.) são verificadas pessoalmente, em visita de auditores desse órgão, com periodicidade de aproximadamente um ano, havendo também o controle à distância, exercido por meio do Controlador Interno, que envia relatórios mensais ao Tribunal de Contas.  
O objetivo do SAAE é manter um constante aperfeiçoamento técnico, para a completa satisfação da população de Atibaia. Suas maiores preocupações são:
- aplicação dos melhores e mais modernos métodos visando manter a qualidade da água;
- realização de obras para manutenção e ampliação do sistema de saneamento básico do município;
- diminuição dos problemas relativos aos resíduos sólidos do município, trabalhando a coleta seletiva e destinando os resíduos finais em locais apropriados e aprovados pela CETESB; 
- atendimento de qualidade ao contribuinte, em espaços confortáveis e bem planejados;
- capacitação dos funcionários, através de cursos e seminários;
- implantação de programas e sistemas de informática, visando a otimização dos procedimentos internos;   
- racionalização no uso dos recursos financeiros, sempre respeitando o dinheiro público.
- desenvolver campanhas educativas e de conscientização para uso responsável dos recursos naturais do município.
Em síntese, o SAAE é um órgão público comprometido com o saneamento básico de Atibaia, procurando levar saúde e bem-estar a toda população.


Números

86%   da população têm água encanada
56%   da população têm coleta de esgoto
75%   do esgoto coletado é tratado
360     quilômetros de redes de água
190     quilômetros de redes de esgoto
90      toneladas de lixo são produzidas por dia
100%  da região urbana têm coleta seletiva
300     toneladas de lixo são recicladas por mês